Varias teorías han sido emitidas atribuyendo(otorgando) al agroglyphes un origen natural (torbellinos, " relámpagos en bola ", torbellino de plasma, campos magnéticos. Sin embargo estas hipótesis explican difícilmente el agroglyphes complejo que tienen formas geométricas elaboradas, circulares o elípticas, a veces múltiples y simétricas, o motivos radiales o angulares, o todavía simétricos incluso asimétricas.